はい、複数の領域を同時に保護することが可能です。
本製品では最大8つ、設定によってはそれ以上のパーティションを保護対象に指定できます。
ただし、ご利用の「保護タイプ」や「モード」によって、保護できる数に以下の制限がございます。

パーティション数に関する制限

• パーティション単位設定： 1番目から8番目までのパーティションが対象です。9番目以降は指定できません。
• ファイル・フォルダ単位設定：
  　- 「修復モード」の場合：9番目以降のパーティションも指定可能です。
  　- 「修復保留モード」の場合：1番目から8番目までが対象となります。

標準的なCドライブ・Dドライブの2領域構成であれば、どのモードでも問題なく保護いただけます。